El racismo sistémico o estructural puede entenderse como una forma de discriminación arraigada en las estructuras sociales e institucionales, ya sea intencional o no, basada específicamente en motivos como la raza, el color, el origen étnico o nacional, la religión y el idioma. El término se acuñó por primera vez en 1984 en Montreal, tras una constatación de la Comisión de Derechos Humanos sobre el alto nivel de discriminación contra los quebequenses de origen haitiano en el sector del taxi. Para muchos investigadores, la sobrerrepresentación de las comunidades negras en los centros de protección infantil y las prisiones, la separación de niños indígenas de sus familias para internarlos en escuelas residenciales y el abuso sexual, físico y psicológico que sufren las mujeres indígenas constituyen expresiones tangibles del racismo sistémico en la sociedad quebequense y canadiense. En el contexto de la salud mental, este racismo estructural o sistémico se manifiesta, entre otras cosas, en:

• La falta de consideración de la expresión cultural en la comprensión de los trastornos mentales,
• La falta de profesionales de la diversidad etnocultural,
• El sobrediagnóstico de trastornos como la esquizofrenia en poblaciones negras.
  Sin embargo, no existe consenso en Quebec sobre la existencia de racismo sistémico, a pesar de que hallazgos, informes y estudios científicos indican que las instituciones quebequenses han heredado el racismo histórico vinculado a la colonización y la esclavitud.